Io non so se intendi meoboot o il suo erede OpenMultiBoot e, soprattutto, non hai detto quale immagine è installata in flash.
Ti posso dire che io, dopo alcune prove, mi trovo benissimo con OBH 0.6 in flash e BH303 in multiboot (con OpenMultiboot, naturalmente).
Il contrario mi dava qualche problema per OBH.